饮食不当
兔子是草食性动物，其消化系统对饮食尤其敏感。错误的饮食习惯是导致兔子拉稀的主要根本原因之一。常见的饮食难题包括突然更换食物、过量喂食零食或是高热量、高糖分的食品。例如，兔子如果突然从干草的饮食转为高水分的新鲜蔬菜，胃肠道可能无法适应，从而导致导致腹泻。而且，兔子需要高纤维的食物来帮助消化。缺乏纤维的饮食不仅会导致消化不良，还可能引发肠道菌群失调，从而导致造成拉稀。所以，对于兔子的饮食管理应当谨慎，确保提供稳定且均衡的饮食，渐进式地更换食物以适应其消化系统。
寄生虫感染
寄生虫是兔子健康的一大隐患，某些寄生虫，比如肠道虫（如蠕虫或原生动物），可以引起严重的消化难题，导致拉稀的症状。这些寄生虫通常通过脏污的饮水、被感染的其他动物或受污染的环境传播。感染初期，兔子可能没有明显的症状，但随着时间推移，拉稀可能成为一个明显的迹象。所以，定期的兽医检查以及虫害驱除是非常关键的，以确保兔子不被寄生虫感染。还可以，保持兔子生活环境的清洁也是防疫的关键，定期清理兔笼和周围环境，可以大大降低寄生虫滋生的风险。
环境根本原因
兔子是对环境变化敏感的动物，任何突如其来的变化都可能导致它们产生应激反应，最终后果是引发拉稀。环境根本原因包括温度变化、湿度过高或过低、噪音刺激、乃至陌生动物的接近等都可能造成兔子的情绪和生理状态发生改变。如果兔子生活在一个温度极端或者通风不良的地方，容易导致消化系统的紊乱。还可以，兔子需要一个安静和安全的环境，以免受到惊吓。养兔者应尽量确保兔子的生活环境舒适、安全，避免频繁移动或改变它们的栖息地，营造一个稳定的生活氛围，有助于维持它们的健康。
应激反应
兔子的情绪状态直接影响着其身体健康。应激反应通常导致内分泌和免疫系统的变化，从而导致影响消化功能。应激源可以是多种根本原因，如带兔子去看兽医、短时间内的人为干扰、或失去同伴等。应激反应不仅可能导致拉稀，还可能导致食欲减退或其他健康难题。所以，主人需要关注兔子的情绪，并采取相应的措施来减轻其压力。例如，提供一个安静的空间，提升与兔子的互动，以及使用一些有助于减轻应激的天然成分，可以帮助兔子保持心理平衡，降低因应激产生的消化难题。
疾病和医学难题
除了饮食和环境根本原因，兔子拉稀还可能是一些潜在疾病的症状。例如，许多消化道疾病、细菌感染及病毒性疾病都可以引发腹泻。在这样的情形下，兔子的拉稀症状可能伴随有其他症状，如食欲减退、精神状态不佳等。如果拉稀持续时间较长，或者伴随着异常的行为变化，应该立即带兔子去看兽医进行专业的诊断和治疗。还可以，免疫系统的弱化也可能让兔子更容易感染。如果兔子曾经出现过拉稀，无论何时都需要及早观察和干预，以便及时发现和处理方式潜在的健康难题。